一、结核分枝杆菌katG基因突变的研究(论文文献综述)
徐峰,饶跃峰,张幸国,朱育银,车洋[1](2020)在《宁波地区结核分枝杆菌基因突变位点确证及与异烟肼、利福平耐药关系研究》文中认为目的阐明宁波地区初治肺结核患者结核分枝杆菌rpoB、katG、inhA基因突变特征,深入分析基因突变与异烟肼、利福平耐药关系,为临床抗结核治疗提供科学依据。方法采用1%比例法对2 455例结核分枝杆菌临床分离株进行药敏检测,对其中的耐药菌株和部分全敏菌株提取DNA,PCR扩增,对耐药菌株katG、inhA、rpoB基因测序,分析3种基因特征及基因突变与单耐药、耐多药关联性。结果 2 455例结核分枝杆菌临床分离株中,发现108例耐药结核分枝杆菌,其中单耐药75例(单耐异烟肼51例,利福平24例),单耐药率为3.05%;33例耐多药,耐多药率为1.34%。33例耐多药菌株中,5例发生inhA基因错义突变,突变率为15.15%(5/33),rpoB基因450位点(ser450leu)突变率为51.52%(17/33),katG基因315位点(ser315thr)突变率为87.88%(29/33),463位点(arg463leu)突变率为78.79%(26/33)。24例单耐利福平菌株中有17例发生rpoB基因错义突变,突变率为70.83%(17/24),主要在446位点(lys446lysarg)发生,该位点突变率为45.83%(11/24)。51例单耐异烟肼菌株中有45例发生katG基因错义突变,突变率为88.23%(45/51),315位点(ser315thr)突变率为72.55%(37/51),463位点(arg463leu)突变率为64.71%(33/51);22例发生inhA基因错义突变,突变率为43.14%(22/51),145位点(val145valgly)突变率为27.45%(14/51);5例发生rpoB基因错义突变,突变率为9.80%(5/51),位点较分散。另外,108例耐药菌株中,有11例菌株发生rpoB、katG、inhA多基因联合突变,且在大多数位点发生错义突变,突变率为10.18%(11/108)。结论 rpoB、katG、inhA基因在450(ser450leu)、315(ser315thr)、446(lys446lysarg)、463(arg463leu)、145(val145valgly)等位点突变和宁波区结核分枝杆菌对异烟肼、利福平耐药密切相关,其中rpoB、inhA基因的主要突变位点和突变频率存在明显地区差异。
徐国超,王延乾,朱明武,李冰,朱晓燕,田鹏飞,郭珊[2](2019)在《结核分枝杆菌基因组变异及其耐药调查》文中提出目的调查结核分枝杆菌基因组变异及耐药情况,分析其耐药机制,以指导临床治疗。方法收集511例结核病患者痰液标本,进行结核分枝杆菌检查及鉴定。采用比例法进行药物敏感性试验;采用PCR扩增gyrA、katG、rpoB、rpsL基因,分析基因变异情况。结果共分离144株结核分枝杆菌,其对氧氟沙星、异烟肼、利福平、链霉素的耐药率分别为60.42%、52.78%、43.75%、36.81%。其中对氧氟沙星、异烟肼、利福平、链霉素低耐和高耐药率分别为36.11%和24.31%、33.33%和19.44%、13.19%和30.56%、4.86%和31.94%,药物低耐率与高耐率之间差异无统计学意义(P>0.05)。72株发生gyrA基因变异,基因突变率为82.76%。其中Asp→Gly在94位点突变39株(44.83%),Ala→Val在90位点突变21株(24.14%),Asp→Ala在94位点突变12株(13.79%)。另15株(17.24%)未发生基因变异。53株发生katG基因变异,基因突变率为69.74%。其中Ser→Thr在315位点突变43株(56.58%),Gly→Ser在299位点突变8株(10.53%),Ser→Gly在315位点突变2株(2.63%)。另23株(30.26%)未发生变异。49株发生rpoB基因变异,基因突变率为77.78%。其中Ser→Leu在521位点突变34株(53.97%),His→Leu在526位点突变13株(20.63%),Leu→Pro在533位点突变2株(3.17%)。另14株(22.22%)未发生变异。41株发生rpsL基因变异,基因突变率为77.36%。其中Lys→Arg在43位点突变37株(69.81%),Lys→Arg在88位点突变4株(7.55%)。另12株(22.64%)未发生变异。结论 gyrA、katG、rpoB、rpsL基因变异可能是导致结核分枝杆菌耐药性逐年增高的主要原因,应给予重视。
杨彩虹,杨敏,于璐,包海洋,吴长新,曹旭东,陈创夫[3](2017)在《高分辨率熔解曲线技术用于结核分枝杆菌临床分离株异烟肼耐药性的快速检测》文中提出目的评价高分辨率熔解曲线分析技术(high-resolution melting curve,HRM)检测结核分枝杆菌异烟肼耐药性的应用价值。方法 1)通过传统比例法药敏实验对本实验室保存的49株结核分枝杆菌进行异烟肼耐药性分析。2)进一步对该结核分枝杆菌进行异烟肼耐药相关基因KatG基因和inhA基因进行异烟肼耐药决定区测序分析,筛查突变位点。3)根据筛查到的突变位点设计高分辨率熔解曲线分析所用的特异性引物,对异烟肼耐药基因耐药决定区进行高分辨率熔解曲线分析检测DNA突变,评估用高分辨率熔解曲线分析技术对结核分枝杆菌异烟肼耐药性检测的效率。结果 1)比例法药敏结果显示,49株实验菌株中20株为异烟肼耐药株,29株为异烟肼敏感株。2)测序分析结果显示:(1)KatG基因出现了4种突变形式,分别是234单位点突变;234、315双位点突变;234、463双位点突变;234、315、463三位点联合突变。(2)inhA基因检测到3种突变,即-8位、-15位、-152位。3)(1)对耐药株的基因突变进行分析发现:20株异烟肼耐药株中11株存在KatG基因第315位密码子的突变、占异烟肼耐药株的55%;6株存在inhA基因-15(4株)位碱基、-8(1株)位碱基、-152(1株)位碱基的突变,共占异烟肼耐药株的30%;2株同时存在基因KatG315密码子和inhA-15位碱基的突变,占异烟肼耐药株的10%;1株均未检测到KatG基因和inhA基因的突变,占异烟肼耐药株的5%。通过基因突变检测结核分枝杆菌异烟肼耐药性的敏感性为95%、特异性为100%。(2)用高分辨率溶解曲线检测实验菌株耐药基因突变的结果显示,18株存在基因突变,24株不存在基因突变,检测的灵敏度为94.7%、特异性为80%。(3)以高分辨率熔解曲线检测到突变为耐药的判断标准,检出19株为耐药株,24株为敏感株。以比例法药敏结果为参照,检测的灵敏度为95%、特异性为82.76%。结论高分辨率溶解曲线用于结核分枝杆菌对异烟肼耐药性的检测具有较好的灵敏度,耗时短,在异烟肼耐药结核病的快速诊断方面具有一定的应用价值。
韦红玉,隆昕颖,凌俊,黄衍强,杨珊,李晓华,陈源红,黄干荣,曾怡[4](2016)在《广西百色地区结核分枝杆菌异烟肼耐药基因特征分析》文中研究表明目的分析百色市地区结核分枝杆菌异烟肼耐药相关基因KatG、inhA的突变特征。方法收集128例结核病患者痰液标本,采用改良罗氏培养基分离培养结核分枝杆菌,绝对浓度法检测异烟肼耐药性,提取耐药菌株DNA,PCR扩增耐药结核分枝杆菌katG、inhA基因序列并分析异烟肼耐药相关基因突变特征。结果分离培养出98例结核分枝杆菌,34株对异烟肼耐药,耐药率为36.7%,耐药菌株KatG基因突变率为44.1%(15/34),其中315位点突变率为66.7%(10/15),出现两个新的突变位点为279(4/15)和427(1/15)。inhA 5位点突变率为13.3%(2/15),inhA 16位点突变率为6.7%(1/15),3株均为katG和inhA联合突变。结论百色地区耐异烟肼结核分枝杆菌耐药性产生与katG和inhA基因突变相关,检测本地区结核分枝杆菌katG和inhA基因突变可预测结核分枝杆菌对异烟肼的耐药性。
王先化[5](2015)在《新疆地区TB合并HIV感染流行病学分析及耐药结核分子机制研究》文中认为研究背景及目的:我国目前结核病疫情仍十分严重,艾滋病感染率呈现逐年增多,两者合并感染的机会显着增加,使结核或艾滋病治疗和控制愈加困难,死亡危险性更高。因此,对高危人群进行HIV感染早期筛查,并同时在HIV感染者中筛查结核病患者,为早期治疗、改善预后以及有效地防控结核感染和与HIV合并感染的传播提供科学依据。然而,结核疫情防治更为严峻的是结核耐药菌株不断增多,结核的发病率逐年增加,严重威胁着人们的身体健康;因此,开展新疆地区的耐药分布情况的调查分析十分重要。初步的科学研究显示结核菌耐药与其基因的突变有关,从基因水平上了解结核耐药的分子机制,有利于建立一种特异、敏感检测方法用于结核感染筛查和耐药患者治疗方案筛选;尤其受到环境因素的影响,不同地区的结核耐药菌株的基因突变情况可能存在较大差异。因此,研究一个地区的结核杆菌基因突变及结核菌的耐药突变基因情况,探讨细胞因子诱导SRC同源2域蛋白(Cytokine-inducible SRC homology 2(SH2)domain protein,CISH)对机体结核感染易感性,了解新疆地区维吾尔族人群CISH基因多态性对当地人群结核发病的影响;可为结核病有效防控提供科学依据。研究方法:采用流行病学横断面调查方法,通过对新疆地区TB/HIV双重感染患者的流行病学特征以及危险因素进行分析,了解我国西部边疆少数民族地区TB合并HIV感染情况。采用分子流行病学方法,收集了2012-2013年乌鲁木齐市四区登记的结核菌培养阳性的菌株,并对菌株进行药敏检测,对药物耐药情况进行分析,观察在初治和复治患者中的结核耐药菌株分布情况。采用改良罗氏培养基比例法计算菌株的耐药百分比,基因测序法进行测序,采用Lasergene软件中的GeneAlign将测序结果与标准菌株H37Rv的基因序列进行比对,确定基因突变位点。采用病例对照研究方法,通过Haploview软件选择CISH基因SNP位点,利用SnapShot法进行SNP基因型的检测,并构建SNPs单倍型。研究结果:1.本次调查共登记结核病人3657例,检测HIV抗体2645例,HIV抗体检测率为72.3%,HIV抗体阳性者128例,阳性检出率为4.8%。≥35岁的结核病患者感染HIV的风险为18-35岁患者的0.26倍(95%CI:0.18-0.40),痰涂片呈阳性的肺结核患者、肺外结核患者感染HIV的风险分别是痰涂片阴性患者的0.43倍(95%CI:0.28-0.66)和1.79倍(95%CI:1.09-2.94)。此次调查共登记HIV感染/AIDS病人2714例,随访到1284例,其中进行结核病筛查1195例,筛查率为93.1%,共发现结核病感染91例,感染率为7.6%。男性HIV感染者/AIDS病人感染结核杆菌的风险为女性的12.2倍(95%CI:6.4-23.1),CD4细胞数量≤200的HIV感染者/AIDS病人感染结核杆菌的风险为CD4细胞数量>200的20.4倍(95%CI:11.8-35.3)。2.新疆地区结核菌株除对AMK的耐药率低于20%外,对其它一线及二线抗结核药物的耐药率都高于30%。而且复治患者的结核菌耐药率明显高于初治患者的结核菌耐药率。对一线抗结核药物的耐药率为54.9%,初治患者对一线抗结核药物的耐药率为35.7%,复治患者对一线抗结核药物耐药率为81.6%。在4种一线抗结核药物中对INH的耐药率最高为46.1%。对EMB的耐药率最低为26.8%。对二线抗结核药物的耐药率为46.1%,初治患者对二线抗结核药物的耐药率为33.3%。复治患者对二线抗结核药物的耐药率为64.3%。在3种二线抗结核药物中,对OFLX的耐药率最高为36.7%,对AMK的耐药率最低为16.2%。3.rpoB基因突变率为59.77%。突变范围为从505位密码子至572位密码子,共有11个位点和14个类型。52例突变菌株中有1例为密码子CAC-TGC的双碱基突变,剩余的都是密码子单碱基突变。基因突变类型有点突变和两个密码子的联合突变。其中52例突变菌株中点突变有44株(84.6%)。突变的密码子为505、516、526、531、533等5个密码子,531位密码子突变最常见。排在第二位的是526位密码子的突变。剩余的8例突变结核菌株为存在两个密码子的联合突变。有18例突变菌株存在katG或inhA基因突变,或两者同时突变。4.与健康对照组相比,CISH基因多态性位点rs17051025在结核病组中的等位基因A的频率高于对照组(P<0.05),基因型AA在结核病组中的频率也是高于健康对照组(P<0.05)。与健康对照组相比,CISH基因多态性位点rs2239751在结核病组中等位基因A的频率较高(P<0.05)。主要的6种单倍体中有三种单倍体(TCCG,ACAG,TCAG)因为其频率小于5%,所以没有进行相关统计。还有三种单倍体组间没有差异。结论:新疆地区结核合并HIV双重感染的比例较高,≥35岁/涂片呈阳性/肺外结核的结核病患者和男性/CD4细胞数量≤200的HIV感染者为高危人群。应进行TB/HIV双向筛查。新疆地区结核菌株对一线及二线抗结核药物的耐药率较高。新疆地区大部分结核菌株耐药基因的突变类型与以往的研究结果是一致的。我国维吾尔族人群中CISH基因SNPs与结核易感性相关,在4个多态性位点中rs17051025及rs2239751是危险因素。建议加强我国西部边疆少数民族地区TB和HIV以及耐药的防控工作,尤其要重视TB合并HIV感染以及耐药结核分子机制方面的探索。
张文艳,张洁莹,柯文鸿,金晶,徐东芳,王莉丽[6](2013)在《合肥地区异烟肼耐药结核分枝杆菌KatG基因突变的分子特征》文中指出目的了解合肥地区结核分枝杆菌异烟肼(Isoniazid,INH)耐药株katG基因突变特点。方法应用PCR-直接测序法对合肥地区肺结核病人痰液中分离的86株结核分枝杆菌的katG基因731bp序列进行测定分析。结果 86株结核分枝杆菌中67株对INH耐药,19株对INH敏感;67株耐INH临床分离株中PCR成功扩增61株,其中56株发生katG基因突变,突变率为91.8%(56/61);katG基因发生联合突变的有30株,突变率为49.2%(30/61),26株发生katG基因单位点突变,突变率为42.6%(26/61)。突变位点主要集中在463位精氨酸和315位丝氨酸,突变率分别为93.4%(57/61)和42.6%(26/61)。而在19株INH敏感株中发现有78.9%(15/19)株存在Arg4631eu突变,突变形式与INH耐药株相同。结论在合肥地区,KatG基因315位密码子突变是菌株INH表型耐药的重要分子基础,以Ser315Thr错义突变为主。KatG基因463位密码子突变与INH耐药表型没有相关性,不是结核杆菌INH耐药的分子标志。该位点突变可能是基因多态性,与结核茵治疗带来的选择性压力无关。
宗兆婧,刘梅,陈杨,王建华,李娜娜,张建勇,张泓,陈玲[7](2012)在《核酸薄膜技术快速检测结核分枝杆菌katG突变的研究》文中认为目的研制一种新的核苷酸薄膜,通过导流杂交技术检测结核分枝杆菌katG基因突变类型,以快速判断结核分枝杆菌对异烟肼的耐受性,寻找一种快速简便检测耐异烟肼结核病的方法。方法根据结核分枝杆菌katG基因序列设计1个野生型及2个常见突变型寡核苷酸特异探针,探针5’末端连接亚甲基(-CH2)。同时设计1个人类基因组探针以及1个生物素探针。制作低密度核苷酸薄膜微阵距列,通过导流杂交技术进行杂交,将杂交结果与DNA测序法对照。结果核酸测序显示,突变位点分别出现在包括315位点在内的7个位点,315位点突变占75.0%(18/24),最常见突变形式为AGC315ACC所致Ser315Thr氨基酸改变。杂交结果与测序结果符合率为93.9%(31/33),与DNA测序相比,其阳性预测值、阴性预测值、敏感度、特异度分别为90.0%、100%、100%、86.7%。结论核酸薄膜导流杂交技术能快速、简便、高效地检测临床标本中有无结核分枝杆菌,并可提示结核分枝杆菌有无异烟肼耐药性,指导临床用药。
黄晓林[8](2011)在《结核分枝杆菌KatG基因突变与异烟肼耐药的关系》文中研究表明研究背景及目的结核病是由结核分枝杆菌(MTB)感染引起的慢性传染性疾病,据WHO估计在全球约有18-22亿的人感染MTB,其中大约有6500万人感染MTB耐药菌株。我国结核的耐药情况尤为严重,总耐药率为29.8%,耐多药率高达12.7%,由此造成的结核病患病率和死亡率居高不下。因此,MTB的耐药机制研究成为结核病研究工作的当务之急。研究表明异烟肼耐药相关基因中最主要的基因为KatG基因,KatG基因的变异(包括突变,缺失等)导致的结核杆菌过氧化物酶活性降低或缺失可以解释90%以上的异烟肼(INH)耐药,但有研究发现某些菌株也可能与其无关,是其它耐药基因所致或存在多种机制,尚需进一步探讨。本研究采用制造突变和修复突变的方法,在结核分枝杆菌标准株上制造KatG基因的缺失,在结核分枝杆INH耐药株上修复突变位点,在结核分枝杆菌INH敏感株上引导突变,然后检测基因重组株的耐药性,观察突变与耐药性之间的联系。材料与方法1、菌株、质粒来源。结核分枝杆菌标准菌株H37Rv由本实验室保存。质粒pKD46由中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所韩延平博士惠赠。2、菌株培养。采用改良罗氏固体培养基(L-J)和Middlebrook 7H9液体培养基相结合的方法培养。3、实验用DNA片段的准备用于敲除DNA片段Knockout的准备:用融合PCR方法将KatG两侧片段KatG-pre与KatG-post连接组成KatG基因敲除片段Knockout;用于修复耐药基因DNA片段Repair的准备:以筛选出的异烟肼耐药株DNA为模版使用带有修复位点的引物扩增出耐药基因位点的修复片段;用于引导突变DNA片段Lead的准备:以筛选出的异烟肼敏感株DNA为模版使用带有引导突变的引物扩增出引导突变基因位点的修复片段。4、菌株DNA片段的导入。将质粒pKD46导入H37Rv菌株、耐药株和敏感株菌体中,筛选质粒导入阳性菌株26℃培养至对数生长期,将敲除片段Knockout、修复片段Repair和引导突变片段Lead分别导入各菌体中。5、鉴定各重组株基因重组结果。试剂盒法提取DNA,用引物扩增目的基因,送测序鉴定。6、鉴定各重组株基因异烟肼药敏结果结果将标准株katG基因敲除株、耐药菌修复株和敏感菌引导突变株进行药敏检测,计算耐药百分比。结果1.培养结果:固体改良罗氏培养基(L-J)和液体Middlebrook 7H9培养基培养的结核分枝杆菌菌株生长良好。2.各重组菌株的构建:序列分析结果确证了KatG基因的敲除株、耐药修复株和敏感引导突变株构建成功。3.耐药分析:药敏结果显示标准株的katG基因被完整敲除后,由完全不耐药变成了80%的耐药。耐药株315位点经过修复后,5株中4株恢复INH的敏感性,而敏感株引导315位突变后,8株中有6株产生耐药性。耐药株463位点经过修复后,6株耐药株仍有5株耐药;而敏感株引导463位点突变后,9株敏感株只有1株敏感株产生耐药性。结论构建了标准株的KatG基因缺失株、异烟肼耐药修复株和异烟肼敏感引导突变株。本研究显示80%的katG缺失株对INH耐药,说明KatG的缺失是结核分枝杆菌耐INH的重要机制;katG315位点变异修复前后和引导变异前后的耐药性变化明显,说明katG基因315密码子的改变与耐药之间有关系;katG463位点变异修复前后和引导变异前后的耐药性变化不明显,这说明INH耐药与463突变无相关性,即463位突变不代表INH耐药。
戎奇吉,吕火祥,孙爱华[9](2011)在《基因芯片快速检测结核分枝杆菌katG基因突变及其与异烟肼耐药相关性》文中研究指明目的了解结核分枝杆菌katG基因S315突变与异烟肼(isoniazid,INH)耐药相关性,建立快速简便的katG基因S315突变基因芯片检测方法。方法采用二倍稀释法检测123株结核分枝杆菌临床分离菌株对INH的耐药性。PCR及测序确定上述结核分枝杆菌katG基因S315位点突变率及突变类型。根据PCR及测序结果,设计Cy3荧光标记探针并制备katG基因S315位点突变检测基因芯片。基因芯片检测结果与PCR及测序结果进行对比分析。结果 123株结核分枝杆菌临床菌株中,39.0%(48/123)菌株对INH敏感,61.0%(75/123)菌株对INH耐药。结核分枝杆菌H37Rv株及所有临床菌株均能扩增出katG基因片段。75株INH耐药菌株中,69.3%(52/75)菌株katG基因出现S315位突变,其中25株突变类型为S315N(AGC→AAC)、12株为S315T(AGC→ACC)、7株为S315I(AGC→ATC)、各有3株分别为S315T(AGC→CGC)和S315R(AGC→AGA)、2株为S315G(AGC→GGC)。所制备的基因芯片对123株结核分枝杆菌katG基因S315野生型或突变型检测结果与PCR及测序结果完全一致。结论结核分枝杆菌katG基因S315突变与INH耐药密切相关。本研究中制备的基因芯片可快速、简便、准确、敏感和特异地检测结核分枝杆菌katG基因S315突变及其类型。
陈杨,陈玲,张泓,王建华,李娜娜,李开伦,甘辛,张建勇[10](2010)在《耐异烟肼结核分枝杆菌及其katG与inhA基因突变的研究》文中研究说明目的探讨耐异烟肼临床分离结核分枝杆菌与其katG及inhA基因突变的相关性。方法对87例临床肺结核患者痰标本进行培养、鉴定及药物敏感性试验,提取菌落DNA、PCR扩增katG和inhA基因片段,并对所有扩增片段进行序列分析。结果 87例菌株经鉴定均为结核分枝杆菌,30(34.5%)例为耐异烟肼菌株,57(65.5%)例异烟肼敏感菌株。30例耐异烟肼株中,18(60%)株出现katG和(或)inhA基因突变。在突变株中,9(50%)株为katG单基因突变,5(27.8%)株为inhA单基因突变,4(22.2%)株为katG和inhA双基因联合突变。两个新突变位点(Val230Met和Pro232Gln)为首次发现,已被美国,欧洲和日本的基因库收录。结论该研究证实结核分枝杆菌katG和inhA基因突变与耐异烟肼相关,为进一步研究异烟肼的抗菌机制奠定了基础。
二、结核分枝杆菌katG基因突变的研究(论文开题报告)
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、结核分枝杆菌katG基因突变的研究(论文提纲范文)
(1)宁波地区结核分枝杆菌基因突变位点确证及与异烟肼、利福平耐药关系研究(论文提纲范文)
1 材料与方法 |
1.1 菌株来源 |
1.2 仪器与试剂 |
1.3 方法 |
1.3.1 DNA提取及光度值测定 |
1.3.2 PCR扩增 |
1.3.3 琼脂糖凝胶电泳 |
1.3.4 测序及结果分析 |
2 结果 |
2.1 药敏结果 |
2.2 DNA光密度值 |
2.3 基因的扩增及琼脂糖凝胶电泳 |
2.4 基因突变和菌株关联分析 |
2.4.1 rpoB基因 |
2.4.2 katG基因 |
2.4.3 inhA基因 |
2.4.4 多基因联合突变 |
3 讨论 |
(2)结核分枝杆菌基因组变异及其耐药调查(论文提纲范文)
材料与方法 |
1 材料 |
1.1 菌株来源 |
1.2 主要仪器与试剂 |
2 方法 |
2.1 药敏试验 |
2.2 目的基因PCR扩增及序列测定 |
2.3 统计学分析 |
结 果 |
1 结核分枝杆菌的耐药性 |
2 gyrA基因变异与氧氟沙星耐药 |
3 katG基因变异与异烟肼耐药 |
4 rpoB基因变异与利福平耐药 |
5 rpsL基因变异与链霉素耐药 |
讨 论 |
(3)高分辨率熔解曲线技术用于结核分枝杆菌临床分离株异烟肼耐药性的快速检测(论文提纲范文)
1 材料与方法 |
1.1 材料 |
1.1.1 菌株 |
1.1.2 主要试剂 |
1.1.3 主要仪器与设备 |
1.2 方法 |
1.2.1 比例法药敏实验 |
1.2.2 结核分枝杆菌DNA的提取及HRM检测模板浓度的标准化 |
1.2.3 异烟肼耐药决定区 (IRDR) DNA测序分析 |
1.2.4 高分辨率熔解曲线 (HRM) 分析 |
1.2.5 统计学分析 |
2 结果 |
2.1 比例法药敏实验结果 |
2.2 异烟肼耐药决定区 (IRDR) DNA测序分析结果 |
2.2.1 目的基因KatG和inhA的扩增结果 |
2.2.2 目的基因KatG和inhA的测序分析 |
2.2.3 各菌株在异烟肼耐药决定区的突变位点分析 |
2.2.4 KatG基因和inhA基因各位点突变类型及密码子变化 |
3 评估用HRM对结核分枝杆菌异烟肼耐药性进行检测的价值 |
3.1 以DNA测序检测到突变判断菌株耐药性的效率 |
3.2 用高分辨率溶解曲线 (HRM) 检测菌株耐药突变的效率 |
3.2.1 目的基因KatG和inhA的HRM扩增 |
3.2.2 KatG基因和inhA基因突变位点的HRM分析 |
3.3 评估高分辨率溶解曲线 (HRM) 检测结核分枝杆菌异烟肼耐药性的应用价值 |
4 讨论 |
(4)广西百色地区结核分枝杆菌异烟肼耐药基因特征分析(论文提纲范文)
1 材料与方法 |
1.1一般资料 |
1.2 方法 |
1.2.1结核分枝杆菌培养及耐药性检测 |
1.2.2基因组DNA提取和katG、inhA基因的PCR扩增和测序 |
1.2.3 DNA序列测定与分析 |
2 结果 |
2.1异烟肼耐药基因鉴定 |
2.2测序比对结果 |
3 讨论 |
(5)新疆地区TB合并HIV感染流行病学分析及耐药结核分子机制研究(论文提纲范文)
摘要 |
ABSTRACT |
引言 |
第一章 新疆地区结核分枝杆菌与艾滋病病毒双重感染的流行病学调查 |
1 材料与方法 |
1.1 研究对象 |
1.2 调查方法 |
1.2.1 相关诊断标准 |
1.2.2 艾滋病的诊断标准 |
1.2.3 结核病合并艾滋病双重感染的界定 |
1.2.4 双向筛查技术 |
1.3 质量控制 |
1.3.1 调查人员的培训 |
1.3.2 预调查 |
1.3.3 调查过程 |
1.3.4 资料录入过程 |
1.4 统计学分析 |
1.5 伦理学考虑 |
2 实验结果 |
2.1 结核病人HIV感染特点及危险因素 |
2.2 HIV感染者/AIDS病人结核病感染特点及危险因素 |
3 讨论 |
4 结论 |
第二章 新疆地区结核分枝杆菌的耐药现状的研究 |
1 材料与方法 |
1.1 菌株及病例来源 |
1.2 主要试剂及仪器 |
1.2.1 主要试剂 |
1.2.2 主要仪器 |
1.3 实验方法 |
1.3.1 标本釆集 |
1.3.2 结核分枝杆菌培养 |
1.3.3 结核分枝杆菌菌种鉴定 |
1.3.4 药敏试验 |
2 实验结果 |
2.1 纳入病例一般情况分析 |
2.2 药敏敏感性试验结果 |
3 讨论 |
4 结论 |
第三章 新疆地区结核病耐药基因突变特征研究 |
1 材料与方法 |
1.1 耐药基因突变分析病例纳入 |
1.2 菌种鉴定和药敏试验 |
1.3 菌基因组DNA提取 |
1.4 实验材料和试剂 |
1.4.1 主要实验试剂及配制 |
1.4.2 主要仪器设备 |
1.5 耐药基因扩增及测序 |
1.5.1 耐药基因扩增及测序 |
1.5.2 测序结果比对 |
1.5.3 数据处理与分析 |
2 结果 |
2.1 耐药基因序列比对结果 |
2.2 耐多药结核分枝杆菌rpoB基因突变特征 |
2.3 耐多药结核分枝杆菌katG基因突变特征 |
2.4 inhA基因突变及其特点 |
2.5 katG基因与inhA基因联合突变 |
2.6 基因突变与药敏的关系 |
3 讨论 |
第四章 新疆地区结核病患者CISH基因遗传易感性研究 |
1 材料和方法 |
1.1 研究对象 |
1.2 实验试剂和仪器 |
1.2.1 主要试剂、试剂盒 |
1.2.2 实验仪器 |
1.2.3 溶液配制 |
1.2.4 琼脂糖凝胶的配置 |
1.3 实验方法 |
1.3.1 血液基因组DNA的提取 |
1.3.2 CISH基因SNP位点的选择 |
1.3.3 遗传平衡定律 |
1.3.4 SNP基因型的检测 |
1.3.5 构建SNPs的单倍型 |
1.3.6 统计学分析 |
2 实验结果 |
2.1 样本DNA质量检测 |
2.2 Hardy-Weinberg遗传平衡检验 |
2.3 病例-对照人群SNP等位基因及其基因型比较 |
2.4 病例-对照人群单倍型比较 |
3 讨论 |
4 结论 |
参考文献 |
综述一 |
参考文献 |
综述二 |
参考文献 |
攻读博士学位期间的研究成果 |
附录 |
致谢 |
(6)合肥地区异烟肼耐药结核分枝杆菌KatG基因突变的分子特征(论文提纲范文)
1 材料与方法 |
1.1 结核分枝杆菌标准株 |
1.2 临床菌株 |
1.3 DNA的提取 |
1.4 引物序列 |
1.5 katG基因目的片段的扩增 |
1.6 PCR产物纯化及DNA测序 |
1.7 序列比对与分析 |
2 结果 |
2.1 INH耐药性检测结果 |
2.2 katG基因PCR扩增结果 |
2.3 katG基因测序分析结果 |
2.3.1 INH敏感株测序结果 |
2.3.2 INH耐药菌株测序结果 |
3 讨论 |
(7)核酸薄膜技术快速检测结核分枝杆菌katG突变的研究(论文提纲范文)
1 材料与方法 |
1.1 标本收集与处理 |
1.2 菌型鉴定及菌株耐药性试验 |
1.3 DNA抽提 |
1.4 PCR扩增结核分枝杆菌KatG基因 |
1.5 核酸序列测定 |
1.6 核酸薄膜导流杂交 |
1.6.1 设计合成薄膜探针 |
1.6.2 薄膜导流杂交 |
1.6.3 薄膜导流杂交结果判读 |
2 结果 |
2.1 耐药性试验结果 |
2.2 基因测序结果 |
2.3 核酸薄膜导流杂交结果 |
3 讨论 |
(8)结核分枝杆菌KatG基因突变与异烟肼耐药的关系(论文提纲范文)
中文摘要 |
英文摘要 |
英文缩写 |
前言 |
材料与方法 |
结果 |
讨论 |
结论 |
参考文献 |
综述 |
参考文献 |
致谢 |
个人简历 |
(9)基因芯片快速检测结核分枝杆菌katG基因突变及其与异烟肼耐药相关性(论文提纲范文)
1 材料和方法 |
1.1 菌株来源 |
1.2 药物敏感试验 |
1.3 DNA模板的制备 |
1.4 引物设计 |
1.5 PCR扩增及产物检测 |
1.6 PCR产物测序 |
1.7 DNA芯片的制备 |
1.8 痰液标本中结核分枝杆菌katG基因S315点突变DNA芯片检测 |
2 结 果 |
2.1 结核分枝杆菌对INH耐药率 |
2.2 临床菌株katG基因携带率 |
2.3 katG基因片段序列分析结果 |
2.4 痰液标本katG基因S315突变芯片检测结果 |
3 讨 论 |
四、结核分枝杆菌katG基因突变的研究(论文参考文献)
- [1]宁波地区结核分枝杆菌基因突变位点确证及与异烟肼、利福平耐药关系研究[J]. 徐峰,饶跃峰,张幸国,朱育银,车洋. 中国现代应用药学, 2020(20)
- [2]结核分枝杆菌基因组变异及其耐药调查[J]. 徐国超,王延乾,朱明武,李冰,朱晓燕,田鹏飞,郭珊. 中国病原生物学杂志, 2019(08)
- [3]高分辨率熔解曲线技术用于结核分枝杆菌临床分离株异烟肼耐药性的快速检测[J]. 杨彩虹,杨敏,于璐,包海洋,吴长新,曹旭东,陈创夫. 中国人兽共患病学报, 2017(05)
- [4]广西百色地区结核分枝杆菌异烟肼耐药基因特征分析[J]. 韦红玉,隆昕颖,凌俊,黄衍强,杨珊,李晓华,陈源红,黄干荣,曾怡. 重庆医学, 2016(01)
- [5]新疆地区TB合并HIV感染流行病学分析及耐药结核分子机制研究[D]. 王先化. 青岛大学, 2015(04)
- [6]合肥地区异烟肼耐药结核分枝杆菌KatG基因突变的分子特征[J]. 张文艳,张洁莹,柯文鸿,金晶,徐东芳,王莉丽. 现代预防医学, 2013(06)
- [7]核酸薄膜技术快速检测结核分枝杆菌katG突变的研究[J]. 宗兆婧,刘梅,陈杨,王建华,李娜娜,张建勇,张泓,陈玲. 中国实验诊断学, 2012(10)
- [8]结核分枝杆菌KatG基因突变与异烟肼耐药的关系[D]. 黄晓林. 河北联合大学, 2011(05)
- [9]基因芯片快速检测结核分枝杆菌katG基因突变及其与异烟肼耐药相关性[J]. 戎奇吉,吕火祥,孙爱华. 中国人兽共患病学报, 2011(03)
- [10]耐异烟肼结核分枝杆菌及其katG与inhA基因突变的研究[J]. 陈杨,陈玲,张泓,王建华,李娜娜,李开伦,甘辛,张建勇. 中国抗生素杂志, 2010(10)