分子动力学书籍读书报告

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问:分子动力学是什么
  1. 答:分子动力学是一门结合物理,数学和化学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法,该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动,以在由分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本,从而计算体系的构型积分,并以碰芹构明吵神型积分的结果为基础进一步计算体系的热力学量和其激亏他宏观性质。
问:分子动力学的文献应该怎么看
  1. 答:分子动力学计算的尺度是原子级别的,可以计算材料的一些微观性质。很多想学习分子动力学的人,都感觉这是一个很难的事。其实这个计算比那个没有想象中的那么难。我下面介绍下快速入门分子动力学的学习步骤:
    1. 找一本介磨兆指绍分子动力学原理的书看下,书越薄越简单越好,最好一下能看懂的那种。另外找3-5份做分子动力学的博士论文看下,只看原理介绍部分。这样你就对分子动力学的原理有了基本的认识。

    2. 接下来学习软件命令,看手册。软件都有自带的例子,把例子拿来对着手册翻翻,看看每个命令是什么意思。在例子中出现频率最高的就是常用命令,一定要对照手册吃透。接下来,快速的把所有指令都看一遍,不求记住,只求看懂有个大概印象。
    3. 接下来就要在网上找几个例子,先跑起来体验下。体验完之后,就要琢磨手册中的例子,试着跑上几个。然后,就是看文献,把跟自己关系最大的文献看明白,重复文献中的结果。边跑文献中的结果,就开始琢磨自己的课题,考虑怎么把自己要计算的内容实现。
    4. 结果后处理猜竖,脚本尽量瞎配从网上下载,把网上下来的脚本研究下,适当改改就可以用了。
    5. 等你把结果做出来就开始写论文了,等一篇论文出来,你基本就很熟悉分子动力学是咋回事了。以后有时间就可以慢慢深入,更细致的了解原理,并不断提高自身的技术。等到非常熟悉有余力以后,就可以琢磨算法了。

    分子动力学除了用来计算材料的微观性质,你还可以以分子动力学算法为研究对象,优化算法。同时还可考虑将分子动力学与第一性原理、人工智能算法结合起来,做出多领域融合的结果。这些对入门者来说有点距离,但只要有想法,好好努力迟早都能实现。
  2. 答:仅供参考
    分子动力学计算的尺度是原子级别的,可以计算材料的一些微观性质。很多想学习分子动力学的人,都感觉这是一个很难的事。其实这个计算比那个没有想象中的那么难。我下面介绍下快速入门分子动力学的学习步骤:
    1. 找一本介绍分子动力学原理的书看下,书越薄越简单越好,最好一下能看懂的那种。另外找3-5份做分子动力学的博士论文看下,只看原理介绍部分。这样你就对分子动力学的原理有了基本的认识。
    2. 接下来学习软件命令,看手册。软件都有自带的例子,把例子拿来对着手册翻翻,看看每个命令是什么意思。在例子中出现频率最高的就是常用命令,一定要对照手册吃透。接下来,快速的把所有指令都看一遍,不求记住,只求看懂有个大概印象。
    3. 接下来就要在网上找几个例子,先跑起来体验下。体验完之后卖信,就要琢磨手册中的例子,试着跑上几个。然后,就是看文献,把跟自己关系最大的文献看明白,重复文献中的结果。边跑文献中的结果,就开始琢磨自己的课题,考虑怎么把自己要计算的内容实现。
    4. 结果后处理,脚本尽量从网上下载,把网上下来的脚本研究下,适当改改就可以用了。
    5. 等你把结果做出来就开始写论文了,等一篇论文出来,你基本就很熟悉分子动力学是咋回事了。以后有时间就可以慢慢深入,更细致的了解原理,并不断提高自身的技术。等到非常熟悉有余力以后,就可以琢磨算法了。
    分子动力学除了用巧配早来计算材料的微观性质孝雀,你还可以以分子动力学算法为研究对象,优化算法。同时还可考虑将分子动力学与第一性原理、人工智能算法结合起来,做出多领域融合的结果。这些对入门者来说有点距离,但只要有想法,好好努力迟早都能实现。
问:分子动力学的简史
  1. 答:1980年:恒压条件下的动力学方法(Andersenの方法、Parrinello-Rahman法)
    1983年:非平衡态动力学方法(Gillan and Dixon)
    1984年:恒温条件下的动力学方法(能势‐フーバーの方法)神皮
    1985年:第一原理分子拿瞎清动力学法(→カー・パリネ消前ロ法)
    1991年:巨正则系综的分子动力学方法(Cagin and Pettit)
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